Để che giấu hành vi vi phạm, Lê Thị Thùy Trang đã xây dựng một hệ thống doanh nghiệp mang danh nghĩa có giấy phép môi trường, ký kết nhiều hợp đồng xử lý chất thải. Tuy nhiên, trên thực tế, toàn bộ hoạt động chỉ dừng lại ở việc thu gom rồi xả thẳng ra môi trường hoặc hợp thức hóa bằng các thủ đoạn gian dối.