Sau khi Nguyễn Thành Nam bị khởi tố, bắt tạm giam liên quan cuốn sách "Chuyện với Thanh - Lời kể mới về ánh sáng", Trường Đại học FPT đã phát đi thông báo chính thức khẳng định ông Nam không còn tham gia công tác quản lý, không giảng dạy tại trường và những nội dung trong cuốn sách không đại diện cho quan điểm của nhà trường.